La leyenda cuenta que los fundadores del Imperio Inca, Manco Cápac y Mama Ocllo, salieron de las aguas sagradas del Lago Titicaca o Mama Qota y adiestraron a los hombres en el manejo de nuevas técnicas agrícolas y a las mujeres en inéditos usos textiles. Pero, miles de años antes, los hijos del lago navegable más alto del mundo venían aplicando una serie de conocimientos, que vertían en sus expresiones artísticas y tecnológicas como señales de una civilización que basaba su economía en los beneficios brindados por este mar andino. A esto se suman las lecciones derivadas de la observación de los fenómenos astronómicos, que los instruían sobre los ciclos vitales de la naturaleza. En la actualidad, Puno es una importante región agrícola y ganadera que conserva el legado de sus antepasados, el cual se manifiesta sobre todo en el campo artístico, en sus inigualables templos precolombinos y cristianos, así como en la variedad, colorido y belleza de sus fiestas, razón esta última por la que esta ciudad del altiplano se erige como la "Capital folclórica del Perú y América". En las selvas de Puno y Madre de Dios también se encuentra una de las reservas intangibles de la humanidad, poseedora de la mayor biodiversidad del planeta: el Candamo, otra razón más para conocer de cerca sus atractivos.

En la región andina de la Meseta del Collao, el clima es seco y varía de templado a frío. En las cumbres nevadas, varía de frío a glaciar, con temperaturas entre 5°C y 13ºC. Las lluvias (de diciembre a abril) son tan abundantes que las crecientes inundan extensos campos agrícolas y de pastoreo. Las heladas producidas por el escenso brusco de la temperatura durante las noches descubiertas de nubes, luego de días soleados, afectan sobremanera los cultivos. Sólo se salvan de esta situación los campos agrícolas que se hallan ubicados a orillas del Lago Titicaca, gracias a que reciben la beneficiosa influencia térmica del lago. Al norte, en la selva, el clima varía de templado a cálido, con temperaturas entre 15°C y 22ºC, y una precipitación fluvial de mil milímetros anuales. Las precipitaciones están influidas por la circulación amazónica y son estacionales, abundantes y más regulares que en el sur.

La flora y fauna del departamento de Puno se encuentra adaptada a las particulares condiciones del medio ambiente de la región. Propios de la zona altoandina son los venados o tarukas, auquénidos como vicuñas, llamas y guanacos, vizcachas, cóndores y pumas. En sus ríos y lagos se han adaptado bien a pesar de la temperatura de las aguas truchas y pejerreyes, que comparten el ecosistema con peces nativos como suches, carachis, mauris, ispis y bogas. En el lago Titicaca viven especies tanto anfibias como terrestres y aéreas que han hecho de este lago su hábitat natural. Así encontramos al pato puna, pato rana, ganso de alas blancas, la polla de agua, cormorán, yanavico, gallineta, gaviota andina y parihuanas. En la región selvática del departamento puneño la variedad y la cantidad de animales es mucho mayor. Nutrias de río, venados, jaguares, rayas de río, camaleones, serpientes, lagartos, perezosos, huanganas, sajinos, tapires, tigrillos, osos de anteojos, águilas arpía y guacamayos son posibles de observar principalmente en las reservas creadas con el fin de proteger dichas especies. En cuanto a la flora, en la parte andina esta no es muy variada siendo el ichu y la totora las plantas más comunes en todo el altiplano. La vegetación en el oriente y especialmente en la frontera con Madre de Dios es exuberante y frondosa, con cientos de especies, algunas descubiertas recientemente y otras desconocidas para el hombre.